Vietcong Fist Alpha sa odohráva pol roku pred Vietcongom 1 v období kedy sa stavia tábor Nui Pek. Hráte sa postavu Warrena Douglasa (na začiatku VC1 sa Hawkins a Hornster vo vrtulníku bavili o ňom). Douglas je velitelom týmu A-216 ale uvažuje o tom že odíde z armády. Zažijete záchranu pilota ktorý spadol v džungli, útok na muničnú továreň Vietcongu, obranu rozostavaného Nui Peku, a útok na velitelstvo Vietcongu.
